130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1130 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 1783 aa  3432    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  34.86 
 
 		 1937 aa  446  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1500 aa  198  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  34.17 
 
 		 1550 aa  198  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  28.21 
 
 		 1441 aa  178  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1395 aa  172  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1451 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1428 aa  147  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  36.1 
 
 		 1463 aa  147  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  35.74 
 
 		 1463 aa  146  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1462 aa  144  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  31.79 
 
 		 2140 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  30.55 
 
 		 1869 aa  137  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1487 aa  135  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  32.78 
 
 		 2032 aa  135  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1396 aa  135  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1423 aa  134  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1538 aa  132  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1392 aa  132  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1489 aa  128  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  27.75 
 
 		 1405 aa  128  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1406 aa  127  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1319 aa  126  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1404 aa  125  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1398 aa  124  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1510 aa  121  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1515 aa  120  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1276 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1276 aa  120  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  40.85 
 
 		 1530 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1448 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1362 aa  117  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  30 
 
 		 1084 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1550 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1578 aa  115  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1270 aa  114  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1276 aa  111  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  33.05 
 
 		 1206 aa  110  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1501 aa  110  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  36.22 
 
 		 1424 aa  81.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1335 aa  77  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1256 aa  72  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1434 aa  67.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1325 aa  64.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1473 aa  63.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1505 aa  62  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25 
 
 		 1243 aa  60.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1377 aa  60.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1223 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1224 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1218 aa  57.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1135  hypothetical protein  30.09 
 
 		 859 aa  58.2  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1224 aa  57  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1206 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1226 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1224 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  24.44 
 
 		 1507 aa  56.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  24.44 
 
 		 1507 aa  55.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1504 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1292 aa  55.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1304 aa  55.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1221 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1346 aa  55.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1453 aa  55.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1259 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1319 aa  54.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1174 aa  54.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1221 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1259 aa  54.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1340 aa  54.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1259 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1443 aa  54.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1259 aa  54.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  27.37 
 
 		 1342 aa  53.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1229 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1259 aa  53.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1255 aa  52.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27 
 
 		 1259 aa  52.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  29.75 
 
 		 1246 aa  52.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  39.34 
 
 		 1448 aa  51.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1369 aa  52  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1317 aa  51.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1297 aa  52  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1299 aa  52  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1258 aa  51.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1256 aa  51.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1453 aa  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  21.59 
 
 		 1285 aa  51.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1226 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1308 aa  50.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1312 aa  50.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1290 aa  50.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1291 aa  50.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1232 aa  51.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  29.17 
 
 		 1249 aa  50.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1319 aa  50.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  27.64 
 
 		 857 aa  50.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  26.87 
 
 		 1515 aa  49.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1305 aa  49.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1259 aa  49.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>