28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1135 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1695    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1423 aa  65.1  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1428 aa  64.7  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1256 aa  63.9  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1406 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1783 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1395 aa  55.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1538 aa  55.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  27.11 
 
 		 1463 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1362 aa  55.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1487 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1398 aa  53.9  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  27.11 
 
 		 1441 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1500 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1463 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1489 aa  51.2  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1328 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1396 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  25 
 
 		 1503 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1869 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  24.02 
 
 		 846 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1226 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1229 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  28.85 
 
 		 846 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1304 aa  44.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1392 aa  44.3  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1224 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1224 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>