19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0253 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1503 aa  2964    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1083  protein of unknown function DUF490  26.57 
 
 
1661 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  22.16 
 
 
1276 aa  67  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  23.84 
 
 
1869 aa  59.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  23.22 
 
 
2140 aa  57  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  23.55 
 
 
2032 aa  55.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  25.92 
 
 
1404 aa  53.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  34.48 
 
 
1405 aa  52.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  26.36 
 
 
1500 aa  52  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  22.44 
 
 
1406 aa  51.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  20.17 
 
 
1515 aa  51.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  22.7 
 
 
1424 aa  48.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  21.86 
 
 
1256 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  26.6 
 
 
1206 aa  47.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1135  hypothetical protein  25 
 
 
859 aa  47  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  22.5 
 
 
1463 aa  46.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  23.44 
 
 
1783 aa  45.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  22.22 
 
 
1335 aa  45.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  24.42 
 
 
1501 aa  45.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>