145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2622 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  83.46 
 
 		 1276 aa  2020    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  83.31 
 
 		 1276 aa  2018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  100 
 
 		 1276 aa  2436    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1501 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  39.7 
 
 		 1084 aa  386  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  38.01 
 
 		 1206 aa  376  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1335 aa  312  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1538 aa  291  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1578 aa  284  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1510 aa  283  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1515 aa  282  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1869 aa  247  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1550 aa  240  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  33.2 
 
 		 2032 aa  235  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1451 aa  230  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  32.78 
 
 		 2140 aa  230  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1404 aa  226  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1423 aa  221  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1428 aa  212  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1463 aa  209  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  33.4 
 
 		 1441 aa  208  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  34.02 
 
 		 1463 aa  205  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1487 aa  204  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1489 aa  201  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  33.74 
 
 		 1530 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1448 aa  175  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  35.1 
 
 		 1424 aa  163  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  31 
 
 		 1500 aa  158  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1406 aa  152  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1270 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1396 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  27.71 
 
 		 1405 aa  144  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  28.32 
 
 		 1448 aa  139  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1462 aa  137  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1398 aa  135  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1319 aa  131  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1392 aa  127  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  29.89 
 
 		 1937 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1395 aa  113  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1783 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1362 aa  109  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  25.81 
 
 		 1550 aa  96.3  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1232 aa  91.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1224 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1223 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1224 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1224 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1206 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1229 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1377 aa  76.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25 
 
 		 1226 aa  75.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1221 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1221 aa  72  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1259 aa  71.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.03 
 
 		 1259 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1258 aa  70.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1259 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1259 aa  70.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1259 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  22.68 
 
 		 857 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1259 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1292 aa  67.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1259 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  22.16 
 
 		 1503 aa  67  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  27.39 
 
 		 1285 aa  67.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1259 aa  66.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1259 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1259 aa  66.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1434 aa  66.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1259 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1259 aa  66.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  25.71 
 
 		 1246 aa  66.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1283 aa  65.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1259 aa  65.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1218 aa  64.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1226 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1273 aa  63.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  28.82 
 
 		 1273 aa  63.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  28.57 
 
 		 1249 aa  63.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1056 aa  61.6  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1262 aa  61.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1505 aa  60.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1352 aa  60.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  26.89 
 
 		 1443 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  27 
 
 		 1259 aa  59.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1319 aa  58.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.45 
 
 		 1243 aa  57  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1473 aa  57.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.94 
 
 		 1304 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  26.32 
 
 		 1285 aa  57  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  25 
 
 		 1256 aa  56.2  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.22 
 
 		 1299 aa  56.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  26.94 
 
 		 1304 aa  55.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1290 aa  55.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1305 aa  55.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  28.5 
 
 		 1359 aa  55.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1308 aa  55.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1340 aa  55.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1265 aa  55.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1291 aa  54.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>