118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3915 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 2032 aa  3950    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1869 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  37.73 
 
 		 1404 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  74.48 
 
 		 2140 aa  2434    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1515 aa  365  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1510 aa  364  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1538 aa  357  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  35.93 
 
 		 1578 aa  333  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1550 aa  312  5e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1451 aa  285  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  33 
 
 		 1441 aa  282  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1423 aa  272  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  33.82 
 
 		 1530 aa  270  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1428 aa  269  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  32.26 
 
 		 1463 aa  267  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1463 aa  260  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1489 aa  247  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  33.2 
 
 		 1276 aa  245  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1448 aa  243  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1487 aa  241  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1276 aa  235  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1276 aa  233  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  32.12 
 
 		 1424 aa  231  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  30.56 
 
 		 1084 aa  205  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  36.91 
 
 		 1206 aa  196  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1319 aa  196  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1501 aa  186  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1500 aa  162  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  30 
 
 		 1396 aa  161  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  24.46 
 
 		 1405 aa  157  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  27.16 
 
 		 1448 aa  155  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1462 aa  154  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1335 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1392 aa  142  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1406 aa  139  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1783 aa  139  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  31.37 
 
 		 1937 aa  123  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1270 aa  121  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.12 
 
 		 1550 aa  121  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1362 aa  118  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1398 aa  118  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1395 aa  117  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.94 
 
 		 1025 aa  78.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1346 aa  77  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1361 aa  74.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.87 
 
 		 1359 aa  70.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1310 aa  70.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1453 aa  69.3  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1401 aa  68.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1377 aa  67.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1292 aa  67.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1226 aa  67  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1369 aa  65.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  24.6 
 
 		 1507 aa  65.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1229 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.28 
 
 		 1243 aa  64.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1218 aa  63.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1473 aa  64.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  24.04 
 
 		 1507 aa  63.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1504 aa  61.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1443 aa  61.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1056 aa  59.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  26.11 
 
 		 1378 aa  59.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1392 aa  59.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  23.32 
 
 		 1304 aa  57.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1224 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1308 aa  57  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1206 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1224 aa  57  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1232 aa  56.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1221 aa  56.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  24.16 
 
 		 1299 aa  56.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1221 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25 
 
 		 1325 aa  56.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  24.16 
 
 		 846 aa  55.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1283 aa  55.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1434 aa  55.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1223 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  23.12 
 
 		 1304 aa  55.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1174 aa  54.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  23.55 
 
 		 1503 aa  55.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1453 aa  53.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1255 aa  53.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  23.42 
 
 		 846 aa  53.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1304 aa  53.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1226 aa  52.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1224 aa  52  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1505 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  27.78 
 
 		 929 aa  52  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  27.78 
 
 		 929 aa  52  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  26 
 
 		 1285 aa  52  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1462  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1273 aa  52.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1317 aa  50.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  28 
 
 		 1174 aa  48.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1352 aa  48.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1358 aa  47.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1449 aa  48.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1305 aa  47.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1360 aa  47.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1372 aa  47.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>