Gene Smon_1083 details

Gene Information

• Locus tag: Smon_1083
• ID: 8600811
• Type: CDS
• Is gene spliced: No
• Is pseudo gene: No
• Organism name: Streptobacillus moniliformis DSM 12112
• Kingdom: Bacteria
• Replicon accession: NC_013515
• Strand: -
• Start bp: 1192920
• End bp: 1197905
• Gene Length: 4986 bp
• Protein Length: 1661 aa
• Translation table: 11
• GC content: 23%
• Product: protein of unknown function DUF490
• Protein accession: YP_003306422
• Protein GI: 269123845

Plasmid Coverage information

• Num covering plasmid clones: n/a
• Plasmid unclonability p-value: n/a
• Plasmid hitchhiking: n/a
• Plasmid clonability: n/a

Fosmid Coverage information

• Num covering fosmid clones: n/a
• Fosmid unclonability p-value: n/a
• Fosmid Hitchhiker: n/a
• Fosmid clonability: n/a

Sequence

Gene sequence

ATGAAAATAG TTAGAAGAAC TTTATCTATT ATACTTCCCA TTTCTTTAAC GATAGCAGGG 
GCTAAGGTAT ATATAGGCTC TGATTCTTTT AAAGAAAATT TAAAATTATT ATTAAATAAT 
GTTTTTGAAT TAAAAGTAGA TTATTCAGAC ATTAAATTAT ATGGTTTATC TAATTTAGAG 
ATTAAAGATT TAAGACTTAA AACTCAAGAT GGGAAAGAAG TTATTTCAGT AGATCTAGCT 
CGGGCAAAGA TTAATCTATT TACACCTACT AGAATATCTG ATGTTGAGTT AATAAATGGT 
AATATATTAT TTGAAAGAAG CTTAGAAGGT ATAAATTTAA AGAGAATACT TCCTAGTTAC 
AATAGTACAG ATTATAGGAG ATTATCATCT ATAAATAAGG TGAGATTTAA AGATATCTCA 
CTAAGATATA TAGATAAATC ATATGATTTA CCTATAGAAA AGGAATTTAA AGATGTAAAT 
GGTTATTTAA TAAGAATGCT TCAATCTAGT CTTGATTTAG AGGCATATGC AAAAACTGAT 
AATAATGAAA AATTAAAAAT CAATATTAAA TTTGATACAA ATCAAAGAAA AGATATCTTA 
GATGTATTTT CTATAAAAAA ATATGATGAA TATAATAAAG AAAAAATGCA ATTTAAGTTT 
GATTTTAATA ATGTTATTTT AACAAAGAAG CTATTTCAAT ATGTACCTAT TAGTAATATG 
GCTTCAGCTC ATAGTGGTAT TGTTAATGGT AATTTGGAAA TAAAAGAAAA TAATGATGAG 
AATTTTGAAT TTTATGGTAA TTTAAATATT AATAATTCTG ATGTGTGGTA TAGGGAATAT 
AAGGGGATAG TAAAAAAAGT TGATGCTAAT GTTAAATTTA ATAAATATGA TATAGATTTA 
AATGGTAAAG GTAAAATTGA TAATGGAGAT ATAGATTTAG GTATTAAATT TAATATTAAT 
GATAATAGAT TAAATGTTAA AACAAATATA GGAAATGTAG ATTATTCTAC ATTAAGAAAA 
TACTCCCTTA TAGAACAGCT GAATATAGAT GGGAAATCTG ATAAGGTAAA TGTAGATATA 
GATTTAGGTT TAAAGATTAC AGATGATGAT TTTGATATAG AAAAATTTGA TGGTAATGTT 
AAGACTAAAT ATTTAAATGT ATTTGATAGT GATATTACTA ATTTTAATTT AAGTTTTAAA 
TTAAAAGAAA AAAATGTAAT TACAATTAAG ACTAAGAATA CTTCTGTTAA TAAAGATATT 
AATGAAGATT TAAATGTTAA GGGGATATTA AGTGCAAATT TTGCTCTAAA TATTAAAAAA 
TTATCTGGAA AAGGTAAATT TAGTATAGAT AATAGAAGTG ATTTTATTAA TCTAAATAGA 
ATTAATGGAG ATGTAGAATT AAAAGATAAT AAAGACATTT TGGTTAATTT TGATGAAAAA 
AAGATTTTTG GAAATGTGAA ATATCTTAAT GATAAAAAAC AAGTTAAATT AACACTTAAA 
GGAAGATCTC TAGTTAATGT AAGGTATATG GAAAATAATG TGGATATTAA ACCTAATATT 
AATAATTTAA CTTATTCACT TTCTAAAAAT TCCCTTATAT CTGGAAATGC AGATATATAT 
GCAAAATCTA ATGATGGAAA ATATTTTGAT AATCTTAATG CAAAGTTAAA AGTTAATAAT 
GGTAGATATG ATGCTAATAT TATTGCAAGA ACTAGTGATG GTGATATAAG TATAAATGGA 
TATACTTCTA AAAATATGGA GCATAAATAT AATTTGGCAG CAAATAATTT TGATATAGTT 
AAATATATGA AAAAAATTGG TGTTAAAAAC TTAGATGAAG TTGAGGGGAA TAAGGAGAGC 
TTTACAGCAA ATATTTCTGC TAAAAATATG GAAGATAAGA TAAAGGTATC ACTAGATTTA 
AATGATCATG TAAACTTTAA ATTTAGGGAT AAAGGAATGG GAATTAAGCC TAAGTTGAAT 
GATTTAGTAT ATAACTTTAA GGATAAAAGT ATTGAATCAG GAGATGTAAA TCTTGGTCTT 
ATAGGTGATG GAAGTATATT TGATAGTATT AGTGCTGGTA TAAGTGTTAA CAATGGTACT 
TTTGATATAA CTTCAATAGT TACTGTTCAA GATGGTAAAT TAGTCCTTAA AGGTAATATT 
GCTAAGGATT TAATTCATTC ATATGAGATT AGCGGGAAAA AGATAGATAT TTTTGAAATA 
GGTAAACTAT TTGGATATAT AGATAAAGAC ATTAATGAAA GTATGAAGGT TGATTTTAAT 
ACTAAAATTA GTGGAGATAT AGAAAATATT AAGGGAGATA TACATATTAG TAGTCCTTAT 
GGGGGATATG TTGCTGAATA TGAAAATCTT GTATTAGATG GTAAGATAAA TAATTTAAAA 
GACTTTGATA TGGATCTTGA TTTATCTGTT GATGAATTAT GGATTAAATA TCAAAGATTT 
ATGAATGTTA AATCTAAAGT TAAAATTAAA AAAGAAGATA TATATGTAGA AGAATTTGGT 
AATGATAAGC TTAAACTAAA AGGGAAATAT AACTTGAAGA CTAGAAAAGT AAACTTAGAA 
TCTAACTTAA ATGCATATAA TATTTATTCT ACTTTTGGAC CAGATATAGA TTTAATAGTA 
AATAATATGA CTTTTAATGT TTATGGAAGC TTAGATAATT TAAATGGAAA TATATCTATA 
GATAAATCCC CTGTAATGTT AAATAAAAAG AAAATTTCTG ATTTTGTTAT GGAAGGTAAT 
ATAGTGAATA ATAAGATCAA TTTAAATAAA ATGAATATTA GAGATAATAA TGTAAGTGGA 
TATTTCAATA TTAAAGACAA GAGCTATGAT GTAAATGTAG AACTTAAGGA AAATAATATA 
GAAGAGTTAG TTGATATTAA TAATTTAAAG CTTAATGTAA CTTCTAATTT AAATATTAAA 
GGTAATTTTG AAAAAACAGA TATTACAGGT AATTTAGATA TAGAAAATTT AAGCTATAAG 
GAATATAGAA TACCTAAGGT ATTTTTAAAT ATTAATCATA AAGATACTAA TATCTTTAAT 
ATTACTAAAA CTGGAATTTT AAATATTAAT AATTTTGAAA TCAAAGATAG TGAGAATAAT 
GAAGTATTTA AATTTAGTGA TAGCTTTGAC TTAGCTAATT TAAATATAGA CTATAACATA 
AGAAACAAAG AAATAGATTT AGGAAAGATA AGTTTATTAA ATCCAGAAAC ATATAAAGGA 
AAAATAATGT TAGATTTAAT ACTTAGACAT AATAAAGAAG AAACTTTAGC ATCATTAAAT 
GTTAAAAGTG ATGAACTATT ATTAAATAGT TTAAAAGTAA CTGATGTATA CTTTGATGTA 
CAGGGAAATG ACAAAATAAT GAATATTTCT GGAGCATATT TAGAATATGA AAATAATCCA 
TTCTTATTAG ATGGTTATGT AAGTTATGCT TTAAATGATT ATAGTTTCAA TTTATTAGCT 
AATGATTTTA ACTTAAAATT CTTAGAAATT AGTGATAAAA TTAAAAAATC TAGTGGAATA 
GCAAACCTTA ACCTATATCT AAAGAAAAAT TTAGTTCAAG GTAAAATTAA TATGAATAAT 
TTCTCACTTG AAACTTTTGA AGATATAGCT AATTTAAATA AAATTAATGC TGATATAGAT 
CTTAAGAATA AGACTATTAG TATTAATGAT TTAAGTGGTA ATGCAAATGG AGGTAGTTTC 
AGTGTATTAG GAAAATTTGA GCTTCCTGAA ATAGCTGATG ATTTCCTGAA ATCTAAAAAG 
ATTAAAACAG GAGCTATAGA AGTTGATACT AAAATAGATA ATGTAAATCT TAAATATATA 
GGTAATAATT TAAAAGTTAC TAGTGATGTT AAAATTGAAA ATAATAAAAT ATTTGGTAAT 
GTAATATTAA ATAATGGAAA TATTGTTAAT GTTTCACCAT TTTTAAAATT AAATAATAAT 
AAGAATAGTT CTAAAAACAA GTTGACTAAT GTTAATGATT ACTTTACTGA ACTTAAAAAT 
CAAATTATTA AAAATATAGT AAACCAACAT ATTTTAGATA TATCTCTTGA AACTGAAAAA 
GATATTAATG TTAATATTCC ATCAGTTGCT GGATTAGTTA AAGATATTAA AGGGAATGCT 
TTTGGTAATG CAAGGGTAGT TTTTGATAGC TCTAACTTAT CGATTTATTC TGACTTGAAT 
GTTAATAAAG GTGAATTTGT TTTAAATGGA CATATATTTA AAGTGGAAGA ATCATCAGTT 
AAATTTACTG GTAATCTTGA TCCGAGTATA GAATTTAAAG CAAGTACTAA TGTAGGTGAG 
GATATAATAA GGATAAAAAT AACAGGGTCA TTAAATAATA GGGAGATAGA GCTAAGTTCT 
GAACAAGGTA AGAATGTTAA TGAGATCTTA GGTATTATAG CACTTAATGA AGAGGGAGGA 
TTACTAGATG TAGATAAGAT TAAAACTACA AATATTGTAG GTAAAGCCTT ATCATCAGCA 
TTAAATAATC TACTGTTTTC AACATTTACT AATAAGGTTA GTTCGACTTT AGGTATAAAT 
GATTTTAAGA TTAAAGCAAA CTTTGATTAT AAAAACAACC TAGAATTTAA GGATATCATA 
AACAACACTA CTACAACATT CTATATCAAC AATCAATTAT TTAATTTAAG TAATATTTAT 
TGGAATGCAG AATTAACAGT TCCATTTGAT TTAAGAATTG ATAGAATAAA AAATGAATTG 
AAATATAACT TGTGGTTAAA CTATTTCTTG AAAAAGGGAA TATCAGCTAC AACTGGTATA 
AAAAGCCCTA TAGAGGTTAC TAATAATAGG ACTAGAACAG CTACATTCTA TACAGGGTTA 
CAATATGATA ATAGATATGG AAGTTTCATG GAAATTATAG ATGATCTTTC AACTTTATTT 
AAAAAGAAAA AGGTACTAAA AAGTGAGGAA AAGAAGAAAA ATAAAATTAA TTTAGAGAGT 
AATTAA 

 

Protein sequence

MKIVRRTLSI ILPISLTIAG AKVYIGSDSF KENLKLLLNN VFELKVDYSD IKLYGLSNLE 
IKDLRLKTQD GKEVISVDLA RAKINLFTPT RISDVELING NILFERSLEG INLKRILPSY 
NSTDYRRLSS INKVRFKDIS LRYIDKSYDL PIEKEFKDVN GYLIRMLQSS LDLEAYAKTD 
NNEKLKINIK FDTNQRKDIL DVFSIKKYDE YNKEKMQFKF DFNNVILTKK LFQYVPISNM 
ASAHSGIVNG NLEIKENNDE NFEFYGNLNI NNSDVWYREY KGIVKKVDAN VKFNKYDIDL 
NGKGKIDNGD IDLGIKFNIN DNRLNVKTNI GNVDYSTLRK YSLIEQLNID GKSDKVNVDI 
DLGLKITDDD FDIEKFDGNV KTKYLNVFDS DITNFNLSFK LKEKNVITIK TKNTSVNKDI 
NEDLNVKGIL SANFALNIKK LSGKGKFSID NRSDFINLNR INGDVELKDN KDILVNFDEK 
KIFGNVKYLN DKKQVKLTLK GRSLVNVRYM ENNVDIKPNI NNLTYSLSKN SLISGNADIY 
AKSNDGKYFD NLNAKLKVNN GRYDANIIAR TSDGDISING YTSKNMEHKY NLAANNFDIV 
KYMKKIGVKN LDEVEGNKES FTANISAKNM EDKIKVSLDL NDHVNFKFRD KGMGIKPKLN 
DLVYNFKDKS IESGDVNLGL IGDGSIFDSI SAGISVNNGT FDITSIVTVQ DGKLVLKGNI 
AKDLIHSYEI SGKKIDIFEI GKLFGYIDKD INESMKVDFN TKISGDIENI KGDIHISSPY 
GGYVAEYENL VLDGKINNLK DFDMDLDLSV DELWIKYQRF MNVKSKVKIK KEDIYVEEFG 
NDKLKLKGKY NLKTRKVNLE SNLNAYNIYS TFGPDIDLIV NNMTFNVYGS LDNLNGNISI 
DKSPVMLNKK KISDFVMEGN IVNNKINLNK MNIRDNNVSG YFNIKDKSYD VNVELKENNI 
EELVDINNLK LNVTSNLNIK GNFEKTDITG NLDIENLSYK EYRIPKVFLN INHKDTNIFN 
ITKTGILNIN NFEIKDSENN EVFKFSDSFD LANLNIDYNI RNKEIDLGKI SLLNPETYKG 
KIMLDLILRH NKEETLASLN VKSDELLLNS LKVTDVYFDV QGNDKIMNIS GAYLEYENNP 
FLLDGYVSYA LNDYSFNLLA NDFNLKFLEI SDKIKKSSGI ANLNLYLKKN LVQGKINMNN 
FSLETFEDIA NLNKINADID LKNKTISIND LSGNANGGSF SVLGKFELPE IADDFLKSKK 
IKTGAIEVDT KIDNVNLKYI GNNLKVTSDV KIENNKIFGN VILNNGNIVN VSPFLKLNNN 
KNSSKNKLTN VNDYFTELKN QIIKNIVNQH ILDISLETEK DINVNIPSVA GLVKDIKGNA 
FGNARVVFDS SNLSIYSDLN VNKGEFVLNG HIFKVEESSV KFTGNLDPSI EFKASTNVGE 
DIIRIKITGS LNNREIELSS EQGKNVNEIL GIIALNEEGG LLDVDKIKTT NIVGKALSSA 
LNNLLFSTFT NKVSSTLGIN DFKIKANFDY KNNLEFKDII NNTTTTFYIN NQLFNLSNIY 
WNAELTVPFD LRIDRIKNEL KYNLWLNYFL KKGISATTGI KSPIEVTNNR TRTATFYTGL 
QYDNRYGSFM EIIDDLSTLF KKKKVLKSEE KKKNKINLES N