101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2396 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  100 
 
 		 1335 aa  2600    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1206 aa  366  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1276 aa  319  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1276 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  37.96 
 
 		 1276 aa  301  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1501 aa  281  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  34.65 
 
 		 1084 aa  273  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1538 aa  269  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1578 aa  253  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1510 aa  251  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1515 aa  250  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1428 aa  189  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1869 aa  174  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1451 aa  170  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1550 aa  167  9e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  29.94 
 
 		 1441 aa  164  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1423 aa  163  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  30.46 
 
 		 2140 aa  158  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1489 aa  156  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1404 aa  153  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1487 aa  153  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  31.04 
 
 		 1463 aa  152  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  29.09 
 
 		 2032 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  30.23 
 
 		 1530 aa  148  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1448 aa  147  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1463 aa  147  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  30.58 
 
 		 1424 aa  136  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1406 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1500 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  28.81 
 
 		 1405 aa  121  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1462 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1396 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1319 aa  107  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1270 aa  106  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1392 aa  101  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.98 
 
 		 1448 aa  101  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1398 aa  93.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1783 aa  89  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  25.55 
 
 		 1550 aa  81.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1395 aa  79.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1362 aa  74.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  28.64 
 
 		 1937 aa  63.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1377 aa  62.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1255 aa  60.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1290 aa  60.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1352 aa  58.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1221 aa  58.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  25 
 
 		 1401 aa  58.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  29.41 
 
 		 1443 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1221 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1223 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1308 aa  56.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1435 aa  57  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1434 aa  56.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1360 aa  56.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1206 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1224 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1232 aa  55.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1224 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1358 aa  55.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1256 aa  55.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1448 aa  55.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1505 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1372 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1372 aa  53.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1319 aa  53.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1372 aa  53.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1372 aa  53.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1372 aa  53.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1372 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1372 aa  53.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1375 aa  53.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  25.47 
 
 		 1304 aa  52  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1226 aa  52  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1226 aa  52  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1229 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  21.19 
 
 		 1243 aa  51.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1224 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1292 aa  51.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1346 aa  51.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  22.08 
 
 		 1254 aa  51.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1259 aa  50.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1254 aa  50.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  22.07 
 
 		 1507 aa  50.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  22.07 
 
 		 1507 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  29.21 
 
 		 1025 aa  50.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1174 aa  50.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1504 aa  49.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.21 
 
 		 1485 aa  49.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1332 aa  48.9  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1218 aa  48.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1392 aa  48.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  25.47 
 
 		 1299 aa  48.5  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1283 aa  48.5  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.87 
 
 		 1485 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.84 
 
 		 1304 aa  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1265 aa  45.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1256 aa  45.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  22.22 
 
 		 1503 aa  45.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1462  hypothetical protein  24 
 
 		 1273 aa  45.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>