184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2388 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 1451 aa  2742    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  68.17 
 
 		 1463 aa  1843    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  41.37 
 
 		 1489 aa  955    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  68.03 
 
 		 1463 aa  1841    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  58.67 
 
 		 1448 aa  1408    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  42.24 
 
 		 1487 aa  960    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  44.07 
 
 		 1424 aa  988    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  58.37 
 
 		 1530 aa  1477    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1423 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  69.38 
 
 		 1441 aa  1885    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  36.29 
 
 		 1428 aa  598  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1869 aa  331  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1515 aa  298  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1510 aa  297  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1578 aa  288  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  33.56 
 
 		 2032 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  32.74 
 
 		 2140 aa  266  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1538 aa  245  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1500 aa  244  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1550 aa  237  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1276 aa  230  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1276 aa  216  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1276 aa  215  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1206 aa  198  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1319 aa  195  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  26.92 
 
 		 1448 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  32.72 
 
 		 1084 aa  188  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1501 aa  165  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1398 aa  164  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1335 aa  163  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1462 aa  162  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  29.18 
 
 		 1550 aa  159  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1392 aa  159  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1396 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  24.21 
 
 		 1405 aa  155  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1783 aa  149  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  34.48 
 
 		 1937 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1270 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1406 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1184 aa  111  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.93 
 
 		 1184 aa  111  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1401 aa  107  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1362 aa  107  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1404 aa  105  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1224 aa  104  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1206 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1224 aa  102  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1224 aa  101  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1377 aa  101  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1308 aa  99.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1395 aa  96.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  28.67 
 
 		 1304 aa  93.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1221 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1232 aa  92.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.46 
 
 		 1243 aa  91.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1392 aa  91.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  28.85 
 
 		 1304 aa  90.9  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1221 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1223 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1434 aa  89  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1352 aa  87.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1218 aa  85.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1255 aa  85.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  26.36 
 
 		 1359 aa  84.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1448 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1325 aa  83.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1453 aa  82.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1262 aa  82.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  28.81 
 
 		 1299 aa  80.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1226 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1229 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1226 aa  79  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  26.6 
 
 		 1426 aa  78.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1256 aa  77.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1292 aa  77  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  28.19 
 
 		 1285 aa  75.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.27 
 
 		 1443 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1453 aa  74.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1473 aa  73.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1259 aa  71.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1310 aa  70.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.5 
 
 		 1273 aa  69.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1297 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1174 aa  69.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1273 aa  69.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1435 aa  68.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  28.89 
 
 		 1285 aa  68.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1664 aa  68.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  26.17 
 
 		 1515 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1310 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1056 aa  67.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1443 aa  67.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1664 aa  66.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1375 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1346 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.27 
 
 		 1485 aa  64.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1305 aa  65.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1319 aa  64.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1372 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1372 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>