23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0447 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4502  protein of unknown function DUF490  33.95 
 
 
1981 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3430  protein of unknown function DUF490  34.9 
 
 
1975 aa  821    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5316  protein of unknown function DUF490  32.46 
 
 
1982 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0447  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1887 aa  3736    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4440  protein of unknown function DUF490  33.9 
 
 
1981 aa  1062    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2674  protein of unknown function DUF490  34.9 
 
 
1975 aa  823    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4575  hypothetical protein  25.36 
 
 
1831 aa  343  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.427026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2994  protein of unknown function DUF490  24.3 
 
 
1813 aa  324  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2878  hypothetical protein  23.31 
 
 
1829 aa  298  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.41175 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4258  protein of unknown function DUF490  24.42 
 
 
1846 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.013451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4219  protein of unknown function DUF490  24.5 
 
 
1846 aa  278  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0342  hypothetical protein  26.79 
 
 
2322 aa  246  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  27.01 
 
 
2049 aa  232  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4866  protein of unknown function DUF490  24.41 
 
 
1601 aa  225  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1788  hypothetical protein  22.08 
 
 
1568 aa  132  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.420849  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40935  predicted protein  21.08 
 
 
926 aa  105  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0925  hypothetical protein  23.88 
 
 
1475 aa  85.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1024  hypothetical protein  22.21 
 
 
1473 aa  81.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.939062  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10621  hypothetical protein  22.74 
 
 
1326 aa  60.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.860868  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06451  hypothetical protein  22.73 
 
 
1319 aa  55.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06451  hypothetical protein  24.86 
 
 
1298 aa  51.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0025  hypothetical protein  20.88 
 
 
1319 aa  51.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18431  hypothetical protein  22.68 
 
 
1478 aa  49.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>