22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17710 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17710  hypothetical protein  100 
 
 
1430 aa  2858    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  20.96 
 
 
1369 aa  68.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  21.76 
 
 
1270 aa  63.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  19.96 
 
 
1515 aa  56.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  22.64 
 
 
1382 aa  55.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  22.55 
 
 
1084 aa  54.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  20.12 
 
 
1428 aa  53.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  20.42 
 
 
1404 aa  53.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  24.78 
 
 
1423 aa  52.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  21.17 
 
 
1229 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  20.95 
 
 
1226 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  19.85 
 
 
1232 aa  49.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  21.83 
 
 
1500 aa  47.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  21.69 
 
 
1276 aa  47  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  25.15 
 
 
1550 aa  46.6  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  20.5 
 
 
2140 aa  47  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  24 
 
 
1869 aa  46.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  22.3 
 
 
1530 aa  46.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  20.5 
 
 
1448 aa  46.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  20.69 
 
 
2032 aa  46.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  22.86 
 
 
1434 aa  45.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  21.4 
 
 
1783 aa  45.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>