107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1758 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  98.63 
 
 
1307 aa  2261    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  100 
 
 
1348 aa  2675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  70.7 
 
 
1264 aa  1833    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  91.67 
 
 
1382 aa  1546    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  34 
 
 
1337 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  98.63 
 
 
1307 aa  2261    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  98.63 
 
 
1307 aa  2261    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  98.49 
 
 
1321 aa  2256    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  99.09 
 
 
1318 aa  2265    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  98.63 
 
 
1307 aa  2261    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  71.55 
 
 
1277 aa  1849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  42.71 
 
 
1266 aa  924    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  61.33 
 
 
1268 aa  1548    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  62.49 
 
 
1247 aa  1594    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  42.89 
 
 
1260 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  32.97 
 
 
1266 aa  633  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  44.59 
 
 
1261 aa  625  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  78.8 
 
 
1268 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  78.39 
 
 
1271 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  76.44 
 
 
1275 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  76.44 
 
 
1275 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  75.86 
 
 
1264 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  30.5 
 
 
1200 aa  545  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  27.27 
 
 
1216 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  30.5 
 
 
1275 aa  509  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  63.66 
 
 
1283 aa  493  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  29.65 
 
 
1281 aa  493  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  29.98 
 
 
1187 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  28.4 
 
 
1210 aa  475  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  27.72 
 
 
1169 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2872  hypothetical protein  27.63 
 
 
1364 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325754  normal  0.590443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  35.03 
 
 
1124 aa  432  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  31.91 
 
 
1065 aa  399  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  48.27 
 
 
1304 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  25.52 
 
 
1261 aa  370  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  46.84 
 
 
1260 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  25.89 
 
 
1354 aa  357  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  28.26 
 
 
1189 aa  343  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  26.9 
 
 
981 aa  333  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  27.64 
 
 
1208 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  26.78 
 
 
1002 aa  310  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  30.92 
 
 
1298 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  26.5 
 
 
1009 aa  300  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  26 
 
 
978 aa  299  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  26 
 
 
978 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  26.5 
 
 
983 aa  294  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  26.57 
 
 
960 aa  290  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  25.42 
 
 
978 aa  287  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  25.78 
 
 
978 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  26.7 
 
 
1072 aa  280  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  25.39 
 
 
1080 aa  278  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  26.61 
 
 
1087 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  26.22 
 
 
1069 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  25.83 
 
 
1119 aa  270  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  29 
 
 
1158 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  26.87 
 
 
1067 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  29.1 
 
 
1154 aa  266  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  26.6 
 
 
1024 aa  266  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  29.58 
 
 
1076 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  25.76 
 
 
1073 aa  264  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  28.9 
 
 
1040 aa  263  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  28.05 
 
 
1151 aa  262  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  28.2 
 
 
1161 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  27.25 
 
 
1098 aa  260  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  27.1 
 
 
1088 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  25.24 
 
 
1013 aa  260  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  26.99 
 
 
1088 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  25.27 
 
 
1061 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  39.21 
 
 
1295 aa  254  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  26.52 
 
 
1128 aa  249  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  43.45 
 
 
1016 aa  246  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  23.44 
 
 
1074 aa  241  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  22.95 
 
 
1011 aa  238  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3490  hypothetical protein  34.92 
 
 
953 aa  231  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  23.26 
 
 
996 aa  228  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3574  protein of unknown function DUF748  34.95 
 
 
957 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3642  protein of unknown function DUF748  34.95 
 
 
955 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  33.87 
 
 
968 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  34.26 
 
 
1032 aa  213  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  23.8 
 
 
1021 aa  210  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  24.11 
 
 
950 aa  210  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  24.06 
 
 
1156 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  24.17 
 
 
1235 aa  199  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  31.92 
 
 
1197 aa  197  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  34.44 
 
 
1181 aa  196  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  23.93 
 
 
1235 aa  196  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  33.83 
 
 
1144 aa  191  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  30.28 
 
 
1135 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  30.56 
 
 
1330 aa  190  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  24.39 
 
 
1112 aa  189  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  38.58 
 
 
1041 aa  182  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  30.68 
 
 
1161 aa  178  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  25.09 
 
 
1428 aa  178  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  21.29 
 
 
982 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  29.26 
 
 
1169 aa  176  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  29.58 
 
 
954 aa  174  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  27.55 
 
 
1022 aa  150  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  36.23 
 
 
1025 aa  140  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  31.44 
 
 
1081 aa  140  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1111  hypothetical protein  31.25 
 
 
806 aa  138  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.685916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>