110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2796 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 1069 aa  2168    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1061 aa  688    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  79.61 
 
 		 1072 aa  1733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  78.73 
 
 		 1067 aa  1699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  49.93 
 
 		 1128 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  78.55 
 
 		 1076 aa  1685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  71.34 
 
 		 1158 aa  957    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  40.71 
 
 		 1119 aa  787    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  63.16 
 
 		 1087 aa  1392    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  72.4 
 
 		 1154 aa  967    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  42.34 
 
 		 1013 aa  838    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  44.24 
 
 		 1073 aa  905    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  70.96 
 
 		 1161 aa  951    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  42.1 
 
 		 1024 aa  843    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1032 aa  805    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  71.22 
 
 		 1151 aa  952    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1074 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1156 aa  568  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  29.47 
 
 		 981 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  28.91 
 
 		 978 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  28.85 
 
 		 978 aa  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  28.95 
 
 		 983 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  29.16 
 
 		 960 aa  386  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  29.05 
 
 		 978 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1002 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  28.82 
 
 		 978 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1009 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1088 aa  354  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1088 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1011 aa  342  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  25.84 
 
 		 954 aa  315  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  30.11 
 
 		 1266 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1189 aa  291  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  26.23 
 
 		 1216 aa  288  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1124 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  31.41 
 
 		 1260 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1181 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1065 aa  282  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  31.13 
 
 		 1261 aa  277  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  27.71 
 
 		 1210 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1264 aa  274  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  23.75 
 
 		 996 aa  273  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1200 aa  268  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1277 aa  268  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1264 aa  261  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  27.17 
 
 		 1208 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1169 aa  259  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1283 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1271 aa  257  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  27.22 
 
 		 1247 aa  257  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1275 aa  257  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1275 aa  257  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1382 aa  254  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1268 aa  254  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1169 aa  254  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1021 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1040 aa  253  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  25.63 
 
 		 1266 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1268 aa  248  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  23.52 
 
 		 950 aa  246  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1041 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1304 aa  237  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3490  hypothetical protein  23.76 
 
 		 953 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  25.3 
 
 		 982 aa  235  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1337 aa  235  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1144 aa  234  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1187 aa  233  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1135 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  24.84 
 
 		 968 aa  230  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1098 aa  224  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3642  protein of unknown function DUF748  25.25 
 
 		 955 aa  224  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3574  protein of unknown function DUF748  25.54 
 
 		 957 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1161 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1260 aa  217  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1016 aa  213  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1298 aa  203  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  24 
 
 		 1261 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1307 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1348 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1307 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1307 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1318 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1307 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1321 aa  199  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1281 aa  196  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  21.39 
 
 		 1080 aa  194  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  25.73 
 
 		 1112 aa  193  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  27.67 
 
 		 1235 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1235 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  23.92 
 
 		 1330 aa  184  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1111  hypothetical protein  29.93 
 
 		 806 aa  184  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.685916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1295 aa  179  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1197 aa  177  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2872  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1364 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325754  normal  0.590443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  30.52 
 
 		 1275 aa  170  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1354 aa  168  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  22.07 
 
 		 1428 aa  165  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  25.24 
 
 		 1081 aa  160  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1022 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1025 aa  143  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>