114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0680 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  100 
 
 		 1187 aa  2373    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  56.81 
 
 		 1200 aa  1310    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  45.21 
 
 		 1189 aa  1000    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  56.65 
 
 		 1169 aa  1345    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  46.08 
 
 		 1208 aa  1004    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  43.95 
 
 		 1216 aa  1005    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  44.65 
 
 		 1210 aa  998    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  32.87 
 
 		 1266 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  32.22 
 
 		 1260 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1264 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1264 aa  532  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1277 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1268 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1275 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1275 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1271 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1283 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  29.27 
 
 		 1247 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1268 aa  486  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  29.45 
 
 		 1266 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1281 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  37.75 
 
 		 1124 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  29.28 
 
 		 1235 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1235 aa  406  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1065 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1261 aa  373  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  34.7 
 
 		 1337 aa  361  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  35.38 
 
 		 1261 aa  360  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1040 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1304 aa  351  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  29.4 
 
 		 981 aa  348  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1295 aa  343  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  28.15 
 
 		 978 aa  332  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  30.42 
 
 		 1382 aa  332  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  27.95 
 
 		 978 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1002 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1298 aa  325  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  27.19 
 
 		 978 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1197 aa  321  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  27.15 
 
 		 978 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  28.83 
 
 		 960 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1009 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  27.35 
 
 		 983 aa  302  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1181 aa  299  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3490  hypothetical protein  29.05 
 
 		 953 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  29.26 
 
 		 968 aa  278  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3574  protein of unknown function DUF748  29.58 
 
 		 957 aa  277  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3642  protein of unknown function DUF748  28.97 
 
 		 955 aa  277  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1013 aa  275  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  40.14 
 
 		 1321 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1307 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1348 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1307 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1307 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1318 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1307 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1011 aa  270  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1088 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1032 aa  269  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1088 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1074 aa  268  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1024 aa  268  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  24.51 
 
 		 1080 aa  262  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1260 aa  261  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1073 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1076 aa  259  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  28.55 
 
 		 950 aa  259  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1067 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  38.23 
 
 		 1275 aa  249  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1072 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  23.99 
 
 		 996 aa  247  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1161 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1119 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1041 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1098 aa  245  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1158 aa  243  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1021 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1154 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1128 aa  240  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  26.7 
 
 		 1330 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1069 aa  238  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1087 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  28.72 
 
 		 1151 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1161 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1156 aa  236  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1061 aa  231  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  23.61 
 
 		 954 aa  228  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  27.49 
 
 		 1428 aa  227  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1169 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1135 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1354 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  25.59 
 
 		 982 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1016 aa  209  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1144 aa  204  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  23.94 
 
 		 1112 aa  195  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  26.38 
 
 		 1081 aa  157  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1025 aa  142  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  28.04 
 
 		 595 aa  140  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1022 aa  140  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1111  hypothetical protein  25.75 
 
 		 806 aa  134  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.685916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>