20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1824 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2054  AsmA  93.06 
 
 
878 aa  1450    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.588924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1903  AsmA  97.5 
 
 
879 aa  1465    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.392482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1824  AsmA  100 
 
 
879 aa  1685    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2868  AsmA family protein  61.62 
 
 
874 aa  942    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0643104  normal  0.0555771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  23.77 
 
 
867 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  25.51 
 
 
809 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  24.62 
 
 
602 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25.76 
 
 
893 aa  50.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  23.2 
 
 
797 aa  50.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  22.33 
 
 
1073 aa  50.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  23.38 
 
 
1494 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  30.2 
 
 
732 aa  49.7  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  25.93 
 
 
1191 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  36.94 
 
 
749 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  25.27 
 
 
1564 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3131  hypothetical protein  29.25 
 
 
1175 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  26.49 
 
 
675 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.44 
 
 
742 aa  44.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  25.46 
 
 
649 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  20.54 
 
 
767 aa  44.3  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>