15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1903 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2054  AsmA  91.81 
 
 
878 aa  1437    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.588924  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2868  AsmA family protein  61.57 
 
 
874 aa  941    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0643104  normal  0.0555771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1824  AsmA  97.5 
 
 
879 aa  1462    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1903  AsmA  100 
 
 
879 aa  1687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.392482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  25.88 
 
 
809 aa  54.7  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25.26 
 
 
893 aa  52.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  23.88 
 
 
1494 aa  52.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  28.96 
 
 
732 aa  52.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  25.08 
 
 
602 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  37.84 
 
 
749 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  25.27 
 
 
1564 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3131  hypothetical protein  28.57 
 
 
1175 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  25.46 
 
 
1191 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.42 
 
 
797 aa  46.2  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.78 
 
 
742 aa  46.2  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>