22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3131 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3131  hypothetical protein  100 
 
 		 1175 aa  2292    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0356  hypothetical protein  47.24 
 
 		 1182 aa  977    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000270654  normal  0.856676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3872  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1188 aa  609  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3788  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1187 aa  602  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1809  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1189 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1264 aa  53.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  28.32 
 
 		 595 aa  53.5  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1277 aa  52.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1275 aa  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1275 aa  52  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1271 aa  52  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.91 
 
 		 797 aa  51.6  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1268 aa  51.6  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1273 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  26.17 
 
 		 1247 aa  48.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1283 aa  47.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1264 aa  46.2  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1271 aa  46.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  20.18 
 
 		 508 aa  45.8  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1271 aa  46.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.44 
 
 		 606 aa  45.8  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  23.4 
 
 		 1104 aa  45.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>