122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2712 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1174    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  25.98 
 
 
960 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  27.79 
 
 
981 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  25.5 
 
 
983 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  25.94 
 
 
978 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  25.5 
 
 
978 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  24.72 
 
 
1009 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  25.5 
 
 
978 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  25.39 
 
 
1088 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  24.72 
 
 
1002 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  26.07 
 
 
1088 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  24.83 
 
 
978 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  26.56 
 
 
1021 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  27.37 
 
 
1169 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  25.13 
 
 
954 aa  143  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  25.19 
 
 
1024 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  25.17 
 
 
1210 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  28.61 
 
 
1189 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  27.37 
 
 
1187 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  25.66 
 
 
1032 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  24.23 
 
 
1208 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  25.85 
 
 
1013 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  23.6 
 
 
1216 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  25.26 
 
 
1154 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  23.86 
 
 
1161 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  28.64 
 
 
982 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  23.86 
 
 
1158 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  25 
 
 
1151 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  24.42 
 
 
1181 aa  133  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  27.01 
 
 
950 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  24.94 
 
 
1011 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  23.71 
 
 
996 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  22.39 
 
 
1061 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  24.01 
 
 
1074 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  26.34 
 
 
1200 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  24.27 
 
 
1067 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  24.16 
 
 
1098 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  24.9 
 
 
1080 aa  127  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  23.39 
 
 
1087 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  24.53 
 
 
1072 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  24.27 
 
 
1076 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  25 
 
 
1135 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  23.79 
 
 
1069 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  24.47 
 
 
1128 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  21.98 
 
 
1119 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1111  hypothetical protein  23 
 
 
806 aa  120  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.685916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  22.69 
 
 
1247 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  23.06 
 
 
1065 aa  118  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  29.55 
 
 
1281 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  23.48 
 
 
1156 aa  116  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  30.45 
 
 
1144 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  22.37 
 
 
1283 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  22.51 
 
 
1081 aa  115  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  25.89 
 
 
1041 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  27.98 
 
 
1073 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  28.57 
 
 
1304 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  27.14 
 
 
1337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  22.88 
 
 
1040 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  32.14 
 
 
1016 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  22.38 
 
 
1161 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  23.84 
 
 
1112 aa  109  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  23.89 
 
 
1169 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  32.27 
 
 
1298 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  24.39 
 
 
968 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  28.57 
 
 
1264 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  28.78 
 
 
1275 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  29.32 
 
 
1295 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  29.58 
 
 
1261 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  26.36 
 
 
1382 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  27.6 
 
 
1264 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  29.49 
 
 
1260 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  26.67 
 
 
1124 aa  104  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  29.27 
 
 
1266 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  26.36 
 
 
1348 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  26.36 
 
 
1318 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  20.41 
 
 
1025 aa  103  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  26.36 
 
 
1307 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  26.36 
 
 
1307 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  26.36 
 
 
1307 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  26.36 
 
 
1321 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  26.36 
 
 
1307 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  27.6 
 
 
1268 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  27.31 
 
 
1268 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  22.03 
 
 
1266 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  25.5 
 
 
1261 aa  100  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  27.76 
 
 
1235 aa  99.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  24.94 
 
 
1197 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3490  hypothetical protein  25.48 
 
 
953 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  21.84 
 
 
1022 aa  100  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2872  hypothetical protein  27.56 
 
 
1364 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325754  normal  0.590443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  27.31 
 
 
1271 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  26.7 
 
 
1277 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  29.47 
 
 
1428 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  26.7 
 
 
1275 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  26.7 
 
 
1275 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  22.05 
 
 
1330 aa  97.4  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  30.67 
 
 
1260 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  23.43 
 
 
1235 aa  95.9  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3574  protein of unknown function DUF748  24.58 
 
 
957 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3642  protein of unknown function DUF748  28.3 
 
 
955 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>