198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1455 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  82.86 
 
 		 283 aa  494  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  75.99 
 
 		 283 aa  461  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  40 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  37.67 
 
 		 387 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  31.15 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  23.34 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.34 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.81 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.37 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  29.06 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.03 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  23.38 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.68 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  24.13 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.48 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.89 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  23.97 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.9 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  22.3 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  22.26 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  23.41 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.25 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  20.98 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  21.53 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.93 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  22.18 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  21.78 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  22.07 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  24.39 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  22.46 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  23.27 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.09 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  23.92 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  27.36 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.52 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  23.15 
 
 		 358 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  23.27 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 329 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 355 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.03 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>