106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0307 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.81 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  30.7 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  28.31 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.41 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  28.84 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  27.57 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  30.09 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.85 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.57 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  27.44 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  23.53 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25.32 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
884 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
312 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.03 
 
 
282 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2370  hypothetical protein  26.92 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  22.27 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  34.21 
 
 
336 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  34.21 
 
 
336 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.46 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  33.61 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.29 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  30.95 
 
 
348 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5103  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.2 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.96 
 
 
341 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
333 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.14 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.7 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  31.46 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  34.67 
 
 
270 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
336 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.62 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
300 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  22.42 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.34 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  26.48 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
414 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.63 
 
 
323 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  30.89 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  22.37 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.25 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  42.31 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.67 
 
 
339 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  28.45 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  30.97 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  41.18 
 
 
330 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>