182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2856 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  100 
 
 
270 aa  550  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  66.29 
 
 
279 aa  361  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  65.8 
 
 
278 aa  352  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  57.68 
 
 
279 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  40.09 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  40 
 
 
283 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  35.94 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  35.57 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  36.6 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  36.08 
 
 
277 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  36.08 
 
 
277 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  37.74 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
289 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  31.13 
 
 
288 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  35.07 
 
 
291 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.72 
 
 
287 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  31.13 
 
 
295 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  34.43 
 
 
286 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  34.12 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  29.72 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  32.08 
 
 
294 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
278 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  34.12 
 
 
289 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  33.18 
 
 
289 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  32.33 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  37.39 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  31.35 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.92 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  32.54 
 
 
276 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  35.51 
 
 
287 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  32.69 
 
 
297 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  35.51 
 
 
287 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  35.05 
 
 
287 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
297 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  34.07 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  30.9 
 
 
287 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
290 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  33.33 
 
 
283 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  35.55 
 
 
305 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
300 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  31.93 
 
 
288 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  32.31 
 
 
293 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
293 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
289 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  34.87 
 
 
285 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  31.1 
 
 
294 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  32.78 
 
 
287 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  33.05 
 
 
291 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
279 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  32.71 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  32.69 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  29.22 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  29.77 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  31 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  32 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  28.37 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  29.38 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.71 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  30.65 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.88 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
246 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
326 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  28.29 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.33 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
334 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  31.41 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  31.61 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
884 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
336 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.69 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  22.27 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  27.68 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  28.34 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  32.17 
 
 
349 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  26.9 
 
 
353 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
336 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  32.43 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>