128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3862 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  64.24 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  61.81 
 
 		 301 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  58.47 
 
 		 884 aa  359  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  58.33 
 
 		 333 aa  358  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  59.52 
 
 		 297 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  63.93 
 
 		 285 aa  357  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  56.57 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  56.79 
 
 		 296 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  55.56 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  55.21 
 
 		 297 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  54.33 
 
 		 309 aa  314  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  52.98 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.45 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  26.41 
 
 		 279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  28.66 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  28.66 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  28.66 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  28.34 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  32.37 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.73 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.46 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.13 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  30.46 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  29.91 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  29.31 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.61 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  22.55 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.29 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  30.2 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  27.03 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  25.73 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.72 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  28.25 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.13 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  25.24 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>