89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1007 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  100 
 
 
301 aa  617  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  62.63 
 
 
311 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  61.81 
 
 
308 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  58.31 
 
 
884 aa  355  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  60.07 
 
 
285 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  54.45 
 
 
297 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  52.17 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  53.4 
 
 
296 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  49.83 
 
 
309 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  51.19 
 
 
297 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  52.17 
 
 
358 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  51.05 
 
 
297 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  50 
 
 
308 aa  275  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  47.14 
 
 
289 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
279 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
300 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
268 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  27.36 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  27.36 
 
 
341 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  27.36 
 
 
385 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  27.04 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.84 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  29.12 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.07 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.16 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
298 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.5 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  28.09 
 
 
245 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.66 
 
 
278 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  28.09 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.15 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.89 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  29.71 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  26.19 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  20.62 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.78 
 
 
282 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  25.68 
 
 
281 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  22.63 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  24.28 
 
 
294 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  23.49 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
218 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.8 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  31.69 
 
 
331 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0363  amidohydrolase 2  30.89 
 
 
339 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0638022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>