72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3202 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  100 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  92.59 
 
 
297 aa  544  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  66.09 
 
 
309 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  60.41 
 
 
297 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  59.66 
 
 
333 aa  330  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  55.21 
 
 
308 aa  323  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  57.59 
 
 
884 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  57.39 
 
 
285 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  57.48 
 
 
296 aa  313  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  58.16 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  54.55 
 
 
311 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  55.75 
 
 
358 aa  308  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  51.19 
 
 
301 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  52.13 
 
 
289 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  28.32 
 
 
279 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  29.08 
 
 
341 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  28.25 
 
 
341 aa  92  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  29.08 
 
 
341 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  29.08 
 
 
385 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.41 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  33.82 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.19 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.91 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.55 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.82 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  25.72 
 
 
273 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.54 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.07 
 
 
300 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.37 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.24 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.37 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.85 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  24.43 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.5 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.37 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  30.82 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.24 
 
 
288 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25 
 
 
283 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  34.72 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  28.09 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
280 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  27.53 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  22.91 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  28.92 
 
 
310 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>