183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4537 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  100 
 
 
295 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  88.85 
 
 
288 aa  550  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  88.11 
 
 
287 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  87.63 
 
 
291 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  76.92 
 
 
287 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  71.53 
 
 
289 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  68.03 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  63.07 
 
 
286 aa  360  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  61.17 
 
 
299 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  59.23 
 
 
290 aa  341  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  56.94 
 
 
289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  63.83 
 
 
293 aa  335  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  56.6 
 
 
289 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  55.9 
 
 
289 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  55.44 
 
 
294 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  52.43 
 
 
291 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  49.14 
 
 
297 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  49.32 
 
 
297 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  45.73 
 
 
300 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  44.83 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  44.83 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  38.03 
 
 
289 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  41.01 
 
 
269 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  36.33 
 
 
293 aa  201  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
294 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  32.42 
 
 
286 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
279 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.13 
 
 
270 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  30 
 
 
265 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  29.15 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  36.68 
 
 
282 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  29.66 
 
 
276 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  34.88 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  34.74 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  28.08 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.74 
 
 
283 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  33.48 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  31.65 
 
 
278 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  32.08 
 
 
288 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
279 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
286 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
276 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
288 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  29.6 
 
 
287 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
283 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  29.5 
 
 
277 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.15 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
287 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  31.65 
 
 
287 aa  99  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.53 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  32.57 
 
 
285 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.31 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  30.46 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  31.33 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  28.95 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  31.01 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  31.01 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  32.26 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  30.36 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  28.38 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  29.15 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  27.89 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  27.06 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.47 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  23.42 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  27.66 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
244 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  24.59 
 
 
331 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.29 
 
 
271 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>