88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0918 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  100 
 
 		 265 aa  550  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  48.48 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  32.31 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  36.9 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  36.75 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  30 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  36.97 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  30.83 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  30 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  30.36 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  38.18 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  32.45 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  29.74 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.7 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 312 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25.6 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  30.72 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  25.12 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  23.15 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  29.53 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  34.65 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.63 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.01 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  24.87 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  28.3 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  24.77 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  27.59 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  27.57 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  25.12 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  20.98 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  21.51 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  24.86 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  22.31 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 334 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4473  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.26 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 358 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 334 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  23.38 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  23.4 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  24.57 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.74 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>