181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1278 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  86.59 
 
 		 278 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  72.1 
 
 		 277 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  73.19 
 
 		 276 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  56.16 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  53.43 
 
 		 278 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  31.47 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  33.48 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  32.43 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  29.68 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  36.36 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  30.58 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  30.14 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  32.2 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  29.83 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  30.12 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  32.58 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  33.73 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  29.32 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  32.93 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  31.68 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  32.38 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  30.72 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 287 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.54 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.42 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  32.49 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  32.49 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  31.98 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  31.84 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  27.63 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  31.3 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  30.81 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  30.81 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  30.46 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  30.81 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  29.95 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  29.27 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  23.41 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.48 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.66 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  24.35 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  20.58 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.22 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>