65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1748 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  100 
 
 		 347 aa  722    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  77.31 
 
 		 336 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  74.77 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  69.83 
 
 		 348 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  63.16 
 
 		 344 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  65.32 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  59.94 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  63.5 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  55.94 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  55.32 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  57.06 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  57.06 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  55.66 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  51.56 
 
 		 364 aa  358  6e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  52.17 
 
 		 353 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  51.32 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  30.82 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  30.5 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  30.75 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  25.72 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  30.69 
 
 		 498 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  27.75 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  25 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 269 aa  53.1  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 286 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.24 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.33 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  20.3 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  24.85 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  24.04 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>