101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1297 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  35.04 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  36.75 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  34.16 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  32.83 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.61 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.93 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  28.89 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.09 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  30.09 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  28.36 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.92 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.03 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25.77 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  23.34 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  28.57 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  25.09 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  30.23 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.44 
 
 		 341 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  20.28 
 
 		 290 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.44 
 
 		 341 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.44 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.79 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  23 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 372 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  25.17 
 
 		 341 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  21.41 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  21.34 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.04 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  21.37 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  22.34 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2002  amidohydrolase 2  38.1 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0199491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  21.53 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 301 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 279 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  21.55 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  26.22 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.58 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  21.3 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 355 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>