95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2788 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 341 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  99.12 
 
 		 341 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  97.95 
 
 		 341 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  31.29 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  28.71 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  30.62 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  28.98 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  28.34 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  27.36 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 884 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.92 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  26.6 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  21.15 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.6 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  21.69 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  21.69 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  21.69 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  32.79 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.45 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  21.4 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  20.28 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  21.69 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.44 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  22.81 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  25.24 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.38 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.33 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  32.12 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  22.54 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  19.77 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 300 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  27.5 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  23.6 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  22.83 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  22.84 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  32.5 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  19.91 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 293 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>