133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2586 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  51.14 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  36.92 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  36.09 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  35.11 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  34.48 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.95 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.83 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.3 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.18 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  28.42 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  31.22 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.8 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.33 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  22.54 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 299 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  24.52 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  26.82 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  23.98 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  20.95 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  25.31 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  28.25 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  22.03 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  24.06 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  26.34 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  24.62 
 
 		 385 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  24.06 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  24.06 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  20.97 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  23.11 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 381 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  22.03 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  21.99 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  22.69 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>