63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2096 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  47.31 
 
 		 280 aa  254  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  40 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  42.75 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  39.64 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  40 
 
 		 387 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  36.24 
 
 		 381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.25 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  27.83 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  22.46 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  38.36 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.7 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  28.39 
 
 		 373 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  22.12 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  38.36 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  20.67 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.44 
 
 		 341 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  36.99 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.15 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.37 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  38.36 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  21.71 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 409 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 409 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 409 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.04 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  34.25 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  22.18 
 
 		 348 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  32.88 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  40.35 
 
 		 394 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 301 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>