173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1788 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  100 
 
 		 364 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  38.59 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  30.7 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  34.75 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.15 
 
 		 350 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.67 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.1 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  31 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.38 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.91 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  31.14 
 
 		 354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.64 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.63 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  29.27 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.72 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 323 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.31 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.19 
 
 		 629 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.49 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.52 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 358 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.94 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.25 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.73 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 313 aa  96.3  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.88 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.22 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  24.47 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25.76 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.9 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.9 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.4 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.97 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  26 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.56 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  20.91 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  24.53 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.19 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  26.05 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.39 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  24.6 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  24.11 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.09 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  22.71 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  20.6 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  22.85 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.22 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.78 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>