75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6375 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  86.22 
 
 		 341 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  86.22 
 
 		 341 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  100 
 
 		 341 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  85.04 
 
 		 341 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  83.58 
 
 		 342 aa  624  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  82.4 
 
 		 342 aa  617  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  82.7 
 
 		 342 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  82.75 
 
 		 342 aa  614  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  83.04 
 
 		 342 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  81.87 
 
 		 342 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  81.29 
 
 		 342 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  79.53 
 
 		 342 aa  597  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  80.06 
 
 		 342 aa  590  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  79.82 
 
 		 342 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  77.94 
 
 		 341 aa  584  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  77.94 
 
 		 345 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  75.07 
 
 		 341 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  70.67 
 
 		 342 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  66.18 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  64.41 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  61.58 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  63.24 
 
 		 349 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  60.29 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  62.35 
 
 		 341 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  62.35 
 
 		 349 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  60.42 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  54.65 
 
 		 353 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  36.2 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  33.53 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  33.14 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  33.14 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.32 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  24.54 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  21.48 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  22.97 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  25.73 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  22.71 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.1 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  30.16 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  21.43 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.22 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.59 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  21.93 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  21.51 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  22.16 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.32 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.21 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  22.08 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  21.94 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  20.96 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  22.18 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  21.07 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.15 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 286 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 276 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  20.92 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>