112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6458 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  100 
 
 
366 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  41.21 
 
 
316 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  40.63 
 
 
316 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  39.05 
 
 
356 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  36.83 
 
 
337 aa  209  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  39.62 
 
 
321 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  38.14 
 
 
315 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  35.81 
 
 
313 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  36.16 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  32.54 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.56 
 
 
339 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
358 aa  92.8  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.71 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  27.05 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.22 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  28.67 
 
 
372 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.74 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  27.12 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.87 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.82 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.66 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.35 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.44 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.02 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.93 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  25.66 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  22.35 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.24 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.44 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  26.67 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  25.22 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  23.98 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  22.06 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  22.03 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.53 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  28.06 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  22.06 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  25 
 
 
323 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.31 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  22.32 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.93 
 
 
629 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  21.81 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.11 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.59 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  23.02 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.98 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  22.9 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
342 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  22.22 
 
 
341 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  25.56 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22.67 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6616  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  23.26 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
342 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  21.57 
 
 
340 aa  56.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  21.76 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  19.22 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  19.22 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.56 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
330 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  20.41 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  22.09 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  21.41 
 
 
339 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.26 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  22.78 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  22.38 
 
 
342 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  21.74 
 
 
343 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  20.35 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.98 
 
 
399 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>