202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2308 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  100 
 
 		 354 aa  714    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  61.15 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  49.39 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  44.05 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  37.76 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  35.44 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  34.1 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.76 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  40.68 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.83 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  38.04 
 
 		 333 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.03 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  37.5 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  34.19 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  34.86 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.9 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.12 
 
 		 629 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  32.32 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  34.01 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.63 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.85 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.22 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.99 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.16 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.73 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  29.18 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  30.4 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.53 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  31.93 
 
 		 361 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  30.29 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  33.17 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.34 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  31.75 
 
 		 358 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  34.48 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  30.96 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  29.76 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  31.5 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  30.2 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  28.01 
 
 		 313 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  28.52 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  28.82 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.04 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 326 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  28.75 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  26.24 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.17 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.1 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  26.81 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.74 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.42 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  24.76 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  24.51 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  20.45 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>