146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2708 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  94.36 
 
 
392 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  100 
 
 
392 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  70.98 
 
 
396 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  69.79 
 
 
394 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  68.83 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  67.71 
 
 
396 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  62.76 
 
 
396 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  62.76 
 
 
396 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  62.76 
 
 
396 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  62.76 
 
 
396 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  62.24 
 
 
396 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  60 
 
 
409 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  58.23 
 
 
409 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  58.23 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  58.23 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  58.23 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  59.9 
 
 
400 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  46.91 
 
 
395 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  44.01 
 
 
409 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  45.03 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  43.86 
 
 
413 aa  349  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  36.98 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  39.25 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  39.19 
 
 
401 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  39.19 
 
 
401 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  38.87 
 
 
408 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  37.98 
 
 
392 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  38.93 
 
 
401 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  34.01 
 
 
399 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
404 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  29.48 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  28.82 
 
 
410 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
397 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
391 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28 
 
 
410 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
378 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  25.56 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  24.94 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
362 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
426 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  22.53 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  22.72 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  23.44 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  21.86 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.79 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  22.91 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  23.11 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.01 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  22.15 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.86 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  21.54 
 
 
433 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.11 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  22.73 
 
 
365 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  21.51 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  20.11 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  22 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
378 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  20.38 
 
 
421 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
354 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  20.92 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  20.92 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  20.92 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  21.47 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  21.74 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>