85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0614 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  100 
 
 		 291 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  41.78 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.25 
 
 		 339 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  32.23 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.77 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  32.4 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  30.86 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.77 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  30.46 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.33 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  30.82 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.8 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.12 
 
 		 629 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.84 
 
 		 339 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.28 
 
 		 342 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.84 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.62 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.73 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.08 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.03 
 
 		 358 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.75 
 
 		 381 aa  85.5  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.63 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.57 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  32.7 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  27.43 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  28.06 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  24 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  26.54 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.84 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  23.35 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  23.59 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.49 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.32 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.32 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  26.12 
 
 		 363 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 340 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  22.13 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  30.53 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 357 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.86 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.17 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  24.7 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  33 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.15 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  30 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  22.08 
 
 		 410 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>