169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1233 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  82.86 
 
 		 282 aa  494  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  80.21 
 
 		 283 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  39.64 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  35.5 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 387 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  30.51 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  24.6 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.41 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.74 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  25.77 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  29.65 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.28 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  27.02 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 289 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.12 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.27 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  22.1 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.01 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.31 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.38 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  22.3 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.52 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  26.41 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  22.42 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  23.84 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  21.51 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  21.91 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  22.18 
 
 		 326 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  23.15 
 
 		 337 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.29 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  21.11 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  23 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  21.82 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  21.59 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  23.33 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.08 
 
 		 351 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  23.33 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  23 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  23.33 
 
 		 385 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.12 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>