105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5784 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  34 
 
 
309 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
286 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
329 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  27.37 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  31.06 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  31.06 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  24.91 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  28.74 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  28.74 
 
 
327 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  26.64 
 
 
368 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  28.74 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  28.74 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  28.74 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  28.74 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  26.06 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  27.09 
 
 
289 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  27.09 
 
 
275 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  25 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.93 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  24.57 
 
 
329 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  25.74 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  27.98 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  27.44 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
312 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  22.42 
 
 
289 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  26.88 
 
 
290 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
304 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.33 
 
 
278 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  29.49 
 
 
304 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  24.04 
 
 
274 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  29.41 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  20.63 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  22.75 
 
 
332 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
327 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.88 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  26 
 
 
302 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  26.02 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  23.87 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  19.93 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  29.15 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  27 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  24.6 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  23.78 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.78 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  24 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  30.29 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
290 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  29.59 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  26.02 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
300 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  25.65 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  25.65 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  25.65 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  25.65 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  25.65 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  24.48 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  25.84 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  22.3 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  23.26 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  22.42 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  26.02 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
282 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  24.58 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>