100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1808 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  100 
 
 
337 aa  702    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  36.83 
 
 
366 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  37.77 
 
 
313 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
315 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  34.45 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  35.04 
 
 
316 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  29.94 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
312 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  31.8 
 
 
367 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.07 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  27.3 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.47 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.27 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.02 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.19 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.1 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.63 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.82 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  24.54 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.68 
 
 
629 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.95 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  24.74 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  21.34 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  21.34 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.79 
 
 
350 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  23.62 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.51 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  22.73 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  24.49 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  21.65 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  22.71 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25 
 
 
283 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.03 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  23.26 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  21.83 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.27 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  23.14 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  23.39 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.15 
 
 
283 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  20 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  22.41 
 
 
337 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  21.84 
 
 
341 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  20.99 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  20.47 
 
 
341 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  20.46 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  23.03 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  22.81 
 
 
342 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  24.13 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  22.57 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  20.54 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6616  hypothetical protein  38.81 
 
 
108 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  28.79 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  22.83 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  22 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  21.98 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  21.89 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  22.83 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  22.96 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  22.05 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  28.79 
 
 
341 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.35 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>