77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7570 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  86.22 
 
 
341 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  92.08 
 
 
341 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  100 
 
 
341 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  84.46 
 
 
341 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  83.92 
 
 
342 aa  614  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  84.5 
 
 
342 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  82.4 
 
 
342 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  80.94 
 
 
342 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  82.7 
 
 
342 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  82.46 
 
 
342 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  81.29 
 
 
342 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  82.7 
 
 
342 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  81.58 
 
 
342 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  80.41 
 
 
342 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  79.41 
 
 
341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  77.35 
 
 
345 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  74.19 
 
 
341 aa  537  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  68.91 
 
 
342 aa  511  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  67.35 
 
 
340 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  64.71 
 
 
339 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  64.71 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  66.18 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  64.99 
 
 
349 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  61.18 
 
 
395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  61.88 
 
 
343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  60.42 
 
 
335 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  55.52 
 
 
353 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  37.09 
 
 
334 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  35.09 
 
 
336 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
337 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  34.12 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23.69 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25.75 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28.81 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
335 aa  59.7  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.94 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.79 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  22.52 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  22.18 
 
 
391 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
391 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25 
 
 
340 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  25.66 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  23.42 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  22.51 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  21.76 
 
 
397 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.36 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.75 
 
 
350 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  20.35 
 
 
366 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  25.16 
 
 
278 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.24 
 
 
395 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  21.02 
 
 
391 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.53 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
283 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
338 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.92 
 
 
348 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  22.08 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
401 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  22.33 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.79 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.99 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  20.88 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  30.12 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  21.74 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  21.89 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.21 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  21.31 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
421 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>