192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1749 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  100 
 
 		 397 aa  826    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  48.3 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  46.17 
 
 		 391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  44.39 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  36.05 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  37.44 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 402 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  29.87 
 
 		 388 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 437 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  27.79 
 
 		 421 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 421 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  29.09 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  27.51 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  27.51 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  23.6 
 
 		 437 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 435 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 398 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.08 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.58 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.32 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  28.75 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  26.45 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.16 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.16 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.16 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 409 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 429 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 396 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 396 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  24.94 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.64 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.24 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.17 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  29.43 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.16 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  25.63 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>