131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2814 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  100 
 
 
341 aa  714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  72.06 
 
 
340 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  69.62 
 
 
339 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  65.5 
 
 
342 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  64.71 
 
 
341 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  64.12 
 
 
341 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  64.71 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  63.93 
 
 
342 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  63.61 
 
 
349 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  64.12 
 
 
341 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  63.82 
 
 
343 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  63.45 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  62.57 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  62.35 
 
 
341 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  63.88 
 
 
349 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  62.17 
 
 
342 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  61.58 
 
 
342 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  63.34 
 
 
342 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  61.63 
 
 
345 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  63.74 
 
 
342 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  61.29 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  61.88 
 
 
342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  62.1 
 
 
342 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  60.88 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  56.3 
 
 
395 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  55.65 
 
 
353 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  57.44 
 
 
335 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  37.24 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  37.8 
 
 
337 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
336 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
342 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.8 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.59 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.78 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.28 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.1 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.65 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  26.02 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  28.05 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28.43 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.29 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  23.67 
 
 
326 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.56 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.4 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
316 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  26.88 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  22.74 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  29.35 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.02 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  20.41 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  21.92 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  21.5 
 
 
397 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.2 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  23.55 
 
 
356 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  21.84 
 
 
337 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  33.33 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  22.35 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.68 
 
 
383 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
270 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  25.58 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  22.42 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  22.8 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>