187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13544 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  65.8 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  63.33 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  56.3 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  35.83 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  36.36 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  35.8 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  33.2 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  33.6 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  30.33 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  35 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  34.5 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  34.5 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  34.1 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  34.5 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  34.54 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  35.37 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  32.14 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  31.8 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  32.91 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  31.05 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  34.22 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  34.23 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  34.23 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  35.51 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  34.16 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  33.49 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  29.36 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  35.88 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  34.05 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  34.05 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  34.05 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  34.84 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 289 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  32.64 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  29.86 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  31.25 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  36.73 
 
 		 300 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  29.3 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  29.52 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  24.59 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  29.73 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  31.4 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  30.13 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  27.96 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  26.12 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.9 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  28.1 
 
 		 884 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  18.32 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  30.33 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  23.59 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.59 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  29.32 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  21.49 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  30.19 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>