77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0338 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  100 
 
 		 311 aa  649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  59.43 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  54.29 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  32.55 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 255 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  23.77 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  27.27 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  23.74 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.32 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25.57 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  30.67 
 
 		 262 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  28.57 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 364 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  24.88 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  28.69 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  24.29 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  22.97 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  21.94 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  27.07 
 
 		 381 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  22.1 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.78 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4473  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.17 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  24 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.63 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.29 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  23.22 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 282 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  22.27 
 
 		 245 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  23 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  21.21 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  23.41 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  23.63 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  22.92 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  22.08 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.59 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.13 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  21.17 
 
 		 348 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>