62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0903 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  32.67 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  32.55 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  33.54 
 
 
324 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  28.26 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.31 
 
 
240 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  28.1 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
295 aa  58.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
387 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.74 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.71 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  24.64 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.94 
 
 
294 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
287 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
309 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  31.98 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
304 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
381 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  27.98 
 
 
299 aa  48.9  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  29.09 
 
 
294 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.59 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  22.98 
 
 
339 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  23.98 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  19.42 
 
 
283 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  20.98 
 
 
282 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  25.42 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29.75 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
355 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  27.41 
 
 
334 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  29.36 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  20.77 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  24.71 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
310 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.32 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
293 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
279 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.18 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  23.03 
 
 
246 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>