43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2374 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  37.8 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  29.02 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  30.92 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5103  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  28.57 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.99 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  23.11 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  22.46 
 
 		 324 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  23.25 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  29 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2002  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0199491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  35 
 
 		 392 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 299 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.02 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.28 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.45 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2369  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  29.49 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 381 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  25 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 387 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 297 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 292 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 288 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>