54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0339 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  100 
 
 		 324 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  54.29 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  53.82 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  33.54 
 
 		 252 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 255 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  29.06 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 258 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25.38 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 264 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  22.46 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  23.75 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  30.86 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  23.12 
 
 		 278 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  22.35 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  22.99 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  23.3 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  30.7 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 261 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  22.86 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  23.4 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  30.51 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  25 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 276 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  21.8 
 
 		 276 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>