86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3079 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  37.8 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2369  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  35.35 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  31.3 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  33.53 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  29.65 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.35 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25.09 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  26.47 
 
 		 381 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  22.55 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  27.52 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.3 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3078  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635173  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5103  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  22.42 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.91 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  22.1 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  30.16 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  22.81 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  28.89 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  23.12 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  22.86 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  22.09 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  29.76 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.26 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1841  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.09 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 386 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.71 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  23.78 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  26.53 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  28.99 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  24.72 
 
 		 320 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  20.11 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.31 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  21.93 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  22.8 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3204  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  23.11 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  22.96 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  21.74 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  21.84 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  20.79 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  27.5 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  23.03 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  21.91 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>