166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4394 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  100 
 
 
298 aa  603  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  100 
 
 
298 aa  603  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  98.99 
 
 
298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  83.39 
 
 
300 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  68.14 
 
 
297 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  59.4 
 
 
297 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  57.84 
 
 
291 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  53.54 
 
 
299 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  50.7 
 
 
293 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  43.45 
 
 
287 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  43.64 
 
 
291 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  44.83 
 
 
295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  43.84 
 
 
288 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  46.9 
 
 
289 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  44.68 
 
 
287 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  47.8 
 
 
286 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  49.3 
 
 
289 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  49.3 
 
 
289 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  48.59 
 
 
289 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  49.65 
 
 
294 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  43.25 
 
 
290 aa  234  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  43.88 
 
 
294 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  42.31 
 
 
294 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
289 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  36.07 
 
 
293 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  32.62 
 
 
269 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  36.07 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
293 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  34.57 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  32.67 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  33.05 
 
 
286 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  29.76 
 
 
282 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
270 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
282 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
276 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  32.49 
 
 
276 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
277 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  32.11 
 
 
279 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
278 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  34.05 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  32.32 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  42.11 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
283 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  32.32 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  32.34 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
278 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  33.85 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  31.1 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  30.84 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  30.74 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  31.02 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  26.09 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  29.8 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2684  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  29.88 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  29.88 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  28.51 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  28.88 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2574  amidohydrolase 2  28.5 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000906856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  30.35 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.08 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  28.92 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  30.67 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  33.99 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.53 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  31.13 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
392 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  23.34 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.22 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
358 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
246 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  29.61 
 
 
244 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.13 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.81 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  30.12 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
884 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
313 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.4 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>